该委员会迄今已举行17次会议，为两国关系发展发挥了积极作用。中方历任首席委员为王兆国、张香山、符浩、杨振亚、郑必坚，日方为石川忠雄、香山健一、冈部达味、小林阳太郎。

　　2003年中日双方调整各自委员，成立新一届中日友好21世纪委员会。新任委员的组成和年龄结构更趋合理，交流方式更加灵活，注重发挥委员自身特点和积极性，提高了委员会的社会影响。2003年12月、2004年9月和2005年7月，新一届委员会会议分别在中国大连、日本东京和中国昆明举行，集中讨论了两国关系面临的突出问题，对外发出了积极信息。