正亲町天皇（1517年6月18日－1593年2月6日），后奈良天皇第二皇子，母亲是万里小路贤房之女万里小路荣子。名叫方仁，于1533年封为亲王。1557年，因为后奈良天皇过世而即位，但是因为皇室实在穷到没钱，极端匮乏，一直到毛利元就等人捐出献金，天皇才在1560年勉强举行即位仪式。

皇室财政窘迫，使得权威扫地难堪，这样的情况一直到织田信长上京以后才有改善。信长需要藉由天皇的权威，发出给敌对势力的和谈敕命。包括1570年时对朝仓义景、浅井长政，1573年对足利义昭，1580年对石山本愿寺等数次战争，都是以正亲町天皇的名义发出和谈敕命，为此信长尊重天皇。信长死后，政权逐渐移转至丰臣秀吉手上，秀吉也採取了利用天皇的态度，使天皇权威提高，并恢復皇宫的修理与朝廷的仪式。于是织田信长、丰臣秀吉与正亲町天皇三边，互相成为一种依赖与利用的关系。

1586年，天皇让位给其孙周仁亲王，并于1593年过世，葬于深草北陵。