灵元天皇(1654年7月9日-1732年9月24日),是后水尾天皇第十六皇子,母亲为内大臣园基音之女园国子(新广义门院),名叫识仁,幼名高贵宫。出生不久后,便成为其兄后光明天皇的养嗣子,同年后光明天皇过世;在高贵宫长大之前,由后西天皇暂时继位以处理政事。1663年,后西天皇正式让位给高贵宫,是为灵元天皇。
天皇个性刚强,意志坚定,作风豪迈。在与幕府交涉时,也很明白的展现自己的立场主张。他也开始恢复大尝祭等古代礼仪,有所贡献。1684年,他开始有让位给皇太子朝仁亲王的想法,但因当时将军德川纲吉慰留,一直到1687年才正式让位,他成为太上皇,并且以上皇的身份实行院政。对于上皇这样刚硬独断的态度,幕府也加强对朝廷的干涉,迫使上皇不得不停止院政。
他于1713年剃髮,成为法皇,法号为「素净」。1732年过世,其谥号取自古代孝灵天皇与孝元天皇,葬于月轮陵。